由北京基因組研究所（國家生物信息中心）主導開發的癌癥單細胞表達圖譜數據庫CancerSCEM正式發布，為癌癥研究領域提供了重要的數據資源與分析平臺。該數據庫系統性地整合、處理并標準化了大量癌癥單細胞RNA測序數據，旨在促進對腫瘤異質性、微環境及治療響應的深入理解。
數據處理是CancerSCEM數據庫構建的核心環節，其流程嚴謹且標準化。研究團隊從公共數據庫及合作項目中廣泛收集原始單細胞RNA測序數據，涵蓋多種癌癥類型及亞型。通過統一的質控管道對原始數據進行過濾，剔除低質量細胞及基因，確保數據可靠性。在標準化處理階段，采用先進的比對、定量及批次校正方法（如使用Cell Ranger、Seurat等工具），以消除技術變異對數據分析的影響。
進一步，數據庫對處理后的數據進行多層次注釋，包括細胞類型識別（通過標記基因及聚類分析）、腫瘤與正常細胞區分、以及功能性富集分析。CancerSCEM還整合了臨床信息與基因組變異數據，支持用戶進行跨樣本、跨癌種的比較研究。所有處理后的數據均以交互式可視化界面呈現，并提供在線分析工具，如差異表達、軌跡推斷及細胞互作分析，極大提升了數據的可訪問性與利用率。
CancerSCEM的發布不僅填補了癌癥單細胞數據整合平臺的空白，其規范化的數據處理流程也為領域內數據共享與分析設立了新標準。隨著數據規模的持續擴展與分析工具的優化，該數據庫有望成為推動精準癌癥研究與合作的關鍵基礎設施。
